Съществуват данни, че около 1853 г. в двора на църквата на с. Карабунар вече съществува килийно училище.
През 1872 г. е построена първата училищна сграда, в която са се помещавали първокласното училище и т.н. Районна прогимназия, в която са се обучавали учениците от селата Карабунар, Бошуля и Памидово.
През 1920 година започва строителството на настоящата училищна сграда. През учебната 1925/1926 година в едното крило на новото училище се обучават 6 паралелки от първоначалното училище, а другите 2 паралелки от районната прогимназия се обучават в "едно старо 50-60 годишно паянтово здание, конструирано от техническата власт негодно и грозящо за срутване", според протоколната книга на училищното настоятелство от 1924 година. По-късно се дострояват помещения и се преместват учениците от прогимназията в новото училище
